内部审核存在的问题有：
1、审核范围未全面覆盖：表现为计划中明确说明需要进行审核的条款，但检查表及记录未能体现。
2、审核员安排不合理：审核员的专业能力未考虑，导致审核过程中不能及时发现存在的问题。
3、审核日程安排不合理：表现为未能结合受审核部门的复杂程度、职责范围的大小来安排时间。
4、最高管理者未参加首、末次会议：导致首、末次会议的召开没有最高管理者的支持和指导。
5、开出的不合格报告不合格事实描述不明确：导致不具重查性，不能将不合格的具体情节描述清楚。
6、不合格项的整改不足：表现为原因分析不到位，纠正措施不合理。 7、不合格项的跟踪验证未及时安排：导致验证的结果报告不明确。
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