申请法院调解的流程如下：
1、先去法院起诉立案，然后在审理法官的主持下，可以进行调解；
2、但是如果有一方不同意调解，最后只能通过判决结案；
3、有的法院有诉前调解程序，去法院立案庭，有专门的法官负责，提交书面手续即可受理，且不用交诉讼费。但诉前调解不成时，再转入诉讼程序。
需要注意的是，民事案件一审适用简易程序的，应当在3个月内审结;适用普通程序的，应当在6个月内审结，有特殊情况经本院院长批准可以延长6个月，还需延长的，报请上级法院批准。二审案件应当从立案之日起3个月内审结，有特殊情况需要延长的，由本院院长批准。
法律依据：
《中华人民共和国治安管理处罚法》
第九条
对于因民间纠纷引起的打架斗殴或者损毁他人财物等违反治安管理行为，情节较轻的，公安机关可以调解处理。经公安机关调解，当事人达成协议的，不予处罚。经调解未达成协议或者达成协议后不履行的，公安机关应当依照本法的规定对违反治安管理行为人给予处罚，并告知当事人可以就民事争议依法向人民法院提起民事诉讼。
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