两种笔迹填写的合同是否有效要根据情况而定，具体情况如下：如果双方对合同内容没有争议，是有效的。但是，如果一方对合同内容有异议，则需要根据具体情况确定合同的真实性。如果一方持有的合同写条款，另一方持有的合同没有相应条款的，法院认定该条款不成立，依法成立的合同对当事人具有法律约束力，当事人应当按照约定履行义务，不得擅自变更或者解除合同，依法成立的合同受法律保护。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第四百六十五条 依法成立的合同，受法律保护。
依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
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