一般不影响，除非仲裁条款本身就是无效的，或变更了仲裁条款。合同中某一条款的变更，并不影响其他条款原有的效力。决定仲裁条款是否有效，一般从以下几方面，约定的仲裁庭是否唯
一、争议解决方式是否同时约定了法院和仲裁庭管辖、约定的仲裁庭是否存在、是否属于仲裁范围等。
1、若约定仲裁协议约定两个以上仲裁机构的，先由双方协商确定仲裁庭，协商不成的，仲裁协议无效；
2、若约定了发生争议既可以由法院管辖，也可以由仲裁庭仲裁的，仲裁协议无效；若一方依据仲裁条款向仲裁庭申请仲裁，另一方未在仲裁庭首次开庭前提出异议的，仲裁庭可以获得管辖权；
3、约定的仲裁庭应是确定的、唯一的；
4、当事人概括约定仲裁事项为合同争议的，基于合同成立、效力、变更、转让、履行、违约责任、解释、解除等产生的纠纷都可以认定为仲裁事项。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国仲裁法》第十七条
有下列情形之一的，仲裁协议无效:
（一） 约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的；
（二） 无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议；
（三） 一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。
《仲裁法》第十八条
仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确的，当事人可以补充协议；达不成补充协议的，仲裁协议无效。
《仲裁法》第十九条
仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。
仲裁庭有权确认合同的效力。
《仲裁法解释》第五条
仲裁协议约定两个以上仲裁机构的，当事人可以协议选择其中的一个仲裁机构申请仲裁；当事人不能就仲裁机构选择达成一致的，仲裁协议无效。
《仲裁法解释》第六条
仲裁协议约定由某地的仲裁机构仲裁且该地仅有一个仲裁机构的，该仲裁机构视为约定的仲裁机构。该地有两个以上仲裁机构的，当事人可以协议选择其中的一个仲裁机构申请仲裁；当事人不能就仲裁机构选择达成一致的，仲裁协议无效。
《仲裁法解释》第七条
当事人约定争议可以向仲裁机构申请仲裁也可以向人民法院起诉的，仲裁协议无效。但一方向仲裁机构申请仲裁，另一方未在仲裁法第二十条第二款规定期间内提出异议的除外。
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