违法建筑的认定是属于行政行为，如果当事人对违法建筑的认定不服的，是可以申请行政复议或者行政诉讼维护自己权益的。
相关法律规定
《中华人民共和国行政诉讼法》
第十二条人民法院受理公民、法人或者其他组织提起的下列诉讼：
(一)对行政拘留、暂扣或者吊销许可证和执照、责令停产停业、没收违法所得、没收非法财物、罚款、警告等行政处罚不服的；
(二)对限制人身自由或者对财产的查封、扣押、冻结等行政强制措施和行政强制执行不服的；
(三)申请行政许可，行政机关拒绝或者在法定期限内不予答复，或者对行政机关作出的有关行政许可的其他决定不服的；
(四)对行政机关作出的关于确认土地、矿藏、水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域等自然资源的所有权或者使用权的决定不服的；
(五)对征收、征用决定及其补偿决定不服的；
(六)申请行政机关履行保护人身权、财产权等合法权益的法定职责，行政机关拒绝履行或者不予答复的；
(七)认为行政机关侵犯其经营自主权或者农村土地承包经营权、农村土地经营权的；
(八)认为行政机关滥用行政权力排除或者限制竞争的；
(九)认为行政机关违法集资、摊派费用或者违法要求履行其他义务的；
(十)认为行政机关没有依法支付抚恤金、最低生活保障待遇或者社会保险待遇的；
(十一)认为行政机关不依法履行、未按照约定履行或者违法变更、解除政府特许经营协议、土地房屋征收补偿协议等协议的；
(十二)认为行政机关侵犯其他人身权、财产权等合法权益的。
除前款规定外，人民法院受理法律、法规规定可以提起诉讼的其他行政案件。
一、违法建筑强制拆除程序
1、案件受理登记
2、现场勘察记录
3、签发《停工(核查)通知书》(应注明：A、上述行为书面说明；B、本人身份证明材料；C、房屋相关材料)。
4、填写《案件立案审批表》(签承办人意见及依据，然后交领导审批同意后做调查笔录)。
5、做《调查询问笔录》(相关说明：A、这个日期那一天不确定，要看当事人配合情况决定。B、做现堪和笔录时，首先亮明身份，由两人以上执法，宣布执法依据；C、内容要具备以下几个要素：房屋所有者是谁，违建的出资建设者是谁，房屋开工日期，房屋所处位置，工程进度，房屋面积、结构(分砖混、砖木、钢架、简易棚亭披屋)，工程造价，完工时间，所作用途，问清是否办理建房手续，告知其违法行为，违反什么法律条款，当事人确认笔录内容，请当事人签名，并紧顶内容下格签名)。
6、给规划部门发商请函，认定是违法建筑。
7、填写《案件处理审批表》(承办人意见及依据，报领导审批)。
8、签发《限期拆除告知书》，限期在何年月日前自行拆除违法建筑，限期日期根据房屋面积，结合裁量权决定，并告知其陈述、申辩权。
9、送达回证
10、限期拆除到期后去核查，填写《核查情况登记表》。
11、填写《拆除违章建筑工作单》，将《拆除违章建筑工作单》报区政府备案。
12、签发《强制拆除决定书》(告知其三个月内的行政复议、诉讼期)。
13、签发《履行行政决定催告书》，限其在7天内自觉履行行政决定。
14、送达回证(限期拆除决定书、履行行政决定催告书可以一次性同时送达)。
15、7天后去核查，填写《核查情况登记表》。
16、签发《强制执行决定书》，告知其三个月内的行政复议、诉讼期。
17、送达《强制执行决定书》。
18、张贴《强制拆除公告》(限其七日内自行拆除，离发《强制执行决定书》1个月)。
19、拟定强拆方案，组织强制拆除制作强拆现场笔录，此时离发《强制执行决定书》三个月后，达到行政复议、诉讼期时间要求。
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