借条笔迹鉴定最好向法院申请，由法院指定鉴定机构。
《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》
第三十一条当事人申请鉴定，应当在人民法院指定期间内提出，并预交鉴定费用。逾期不提出申请或者不预交鉴定费用的，视为放弃申请。
对需要鉴定的待证事实负有举证责任的当事人，在人民法院指定期间内无正当理由不提出鉴定申请或者不预交鉴定费用，或者拒不提供相关材料，致使待证事实无法查明的，应当承担举证不能的法律后果。
第三十二条人民法院准许鉴定申请的，应当组织双方当事人协商确定具备相应资格的鉴定人。当事人协商不成的，由人民法院指定。
人民法院依职权委托鉴定的，可以在询问当事人的意见后，指定具备相应资格的鉴定人。
人民法院在确定鉴定人后应当出具委托书，委托书中应当载明鉴定事项、鉴定范围、鉴定目的和鉴定期限。
一、债务纠纷的证据种类有哪些？
证据包括：
(一)当事人的陈述；
(二)书证；
(三)物证；
(四)视听资料；
(五)电子数据；
(六)证人证言；
(七)鉴定意见；
(八)勘验笔录。
证据必须查证属实，才能作为认定事实的根据。
二、什么情形下借条无效？
(一)明知对方借款用于非法活动的
合法的借贷关系受法律保护，但违反法律或社会公共利益的民事行为属于无效行为。法院查明，出借人明知个人借款用于赌博、贩卖假币、贩卖毒品、走私等非法活动而借款给他人，其借贷合同不受法律保护，对行为人还要处以收缴、罚款、拘留，甚至追究刑事责任。
(二)违背真实意愿的借条
一方以欺诈、胁迫等手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的合同，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销合同。受损害方的变更权或撤销权应当依法行使。
(三)感情债所产生的借条
不少情人之间出于玩笑或者其他原因(例如：青春损失费，精神损失费，出轨劈腿等)，会写下借条，但实际中并没有这笔借款支付的凭证。如果分手或者离婚了，一方拿着借条要求法院判决对方还钱，法院通常会要求提供一系列的证据链，没有其他证据只有借条的，借条无效。
(四)有借条但没有实际支付借款
借条只能证明借贷双方之间有约定，如果没有实际支付借款，借条实际上是不产生法律效力的。