据《泉州府志》记载，清源山最早开发于秦代，中兴于唐代，宋元时期最为鼎盛。经过了历代开发，山上留下了大量文物古迹现存完好的有宋、元时期石雕造像7处9尊，历代摩崖石刻近600多方，元、明两代花岗岩仿木结构的石室多处。
宋代老君造像，系全国最大的、艺术价值最高的道教石雕;九日山祈风石刻，是研究中国古代海外交通史和书法艺术的珍贵资料;唐武德年间，穆罕默德门徒三贤、四贤来泉州传教，殁葬于灵山，称伊斯兰圣墓。其旁有郑和第五次下西洋的“行香碑”，为中国海外交通的重要史迹。
诗词歌赋
历代文士、武将、高僧、权贵游山，在清源山留下400方碑刻和崖刻。北宋米芾的“第一山”，明将俞大猷的“君恩山重”，现代高僧泓一法师遗墨“悲欣交集”，备受景仰。清源山流传无数的典故、传说、神话等等，使名山更具深刻的文化。
宋·钱熙：《清源山》“巍峨堆压郡城阴，秀出天涯几万寻。翠影倒时吞半郭，岚半凝处滴疏林。”
陈子昂：《 感遇》“朅来豪游子，势利祸之门。如何兰膏叹，感激自生冤。众趋明所避，时弃道犹存。云渊既已失，罗网与谁论。箕山有高节，湘水有清源。唯应白鸥鸟，可为洗心言。”
白居易：《香》“香炉峰北面，遗爱寺西偏。白石何凿凿，清流亦潺潺。有松数十株，有竹千余竿。松张翠伞盖，竹倚青琅玕。其下无人居，惜哉多岁年。有时聚猿鸟，终日空风烟。时有沉冥子，姓白字乐天。平生无所好，见此心依然。如获终老地，忽乎不知远。架岩结茅宇，斫壑开茶园。何以洗我耳，屋头落飞泉。何以净我眼，砌下生白莲。左手携一壶，右手挈五弦。傲然意自足，箕踞于其间。兴酣仰天歌，歌中聊寄言。言我本野夫，误为世网牵。时来昔捧日，老去今归山。倦鸟得茂树，涸鱼返清源。舍此欲焉往，人间多险艰。”
白居易：《南池》“萧条微雨绝，荒岸抱清源。入舫山侵塞，分泉道接村。秋声依树色，月影在蒲根。淹泊难遂，他宵关梦魂。”
杜牧：《昔事文皇帝三十二韵》：“昔事文皇帝，叨官在谏垣。奏章为得地，齚齿负明恩。金虎知难动，毛釐亦耻言。撩头虽欲吐，到口却成吞。照胆常悬镜，窥天自戴盆。周钟既窕槬，黥阵亦瘢痕。凤阙觚棱影，仙盘晓日暾。雨晴文石滑，风暖戟衣翻。每虑号无告，长忧骇不存。随行唯跼蹐，出语但寒暄。宫省咽喉任，戈矛羽卫屯。光尘皆影附，车马定西奔。亿万持衡价，锱铢挟契论。堆时过北斗，积处满西园。接棹隋河溢，连蹄蜀栈刓。漉空沧海水，搜尽卓王孙。斗巧猴雕刺，夸趫索挂跟。狐威假白额，枭啸得黄昏。馥馥芝兰圃，森森枳棘藩。吠声嗾国猘，公议怯膺门。窜逐诸丞相，苍茫远帝阍。一名为吉士，谁免吊湘魂。间世英明主，中兴道德尊。昆冈怜积火，河汉注清源。川口堤防决，阴车鬼怪掀。重云开朗照，九地雪幽冤。我实刚肠者，形甘短褐髡。曾经触虿尾，犹得凭熊轩。杜若芳洲翠，严光钓濑喧。溪山侵越角，封壤尽吴根。客恨萦春细，乡愁压思繁。祝尧千万寿，再拜揖余樽。