双方离婚两个孩子的判决方式:一般在司法实践中,根据最有利于子女的原则,确认夫妻一方一个孩子。但是如果一方能够证明另一方患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病,子女不宜与其共同生活等情形的,两个孩子可能均由一方抚养。
《中华人民共和国民法典》
第一千零八十四条
父母与子女间的关系,不因父母离婚而消除。离婚后,子女无论由父或者母直接抚养,仍是父母双方的子女。
离婚后,父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后,不满两周岁的子女,以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女,父母双方对抚养问题协议不成的,由人民法院根据双方的具体情况,按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的,应当尊重其真实意愿。