法律分析：工伤赔偿案中，调解协议可在赔偿确认前或确认后签署，具体取决于当事人的意愿和案件的实际情况。在签署调解协议前，应当明确赔偿金额、赔偿方式等具体标准，以保证双方权益得到保障。签署调解协议后，应当认真履行协议约定，否则可能会导致违约责任或诉讼的风险。
法律依据：
1.《中华人民共和国工伤保险条例实施细则》第四十七条：用人单位与工伤保险赔偿申请人可以在双方自愿、平等、公正的原则下，书面签订和解协议。和解协议应当载明和解的赔偿金额、赔偿方式等内容。
2.《中华人民共和国劳动合同法》第四十九条：用人单位应当为劳动者办理工伤保险，并依法缴纳工伤保险费用。
3.《中华人民共和国侵权责任法》第五十九条：当事人之间就侵权责任建立协议的，应当在侵权行为造成损害后进行，协议必须合法、公正、平等、自愿，不得违反法律规定。
以上法律规定表明，工伤赔偿案中可以进行调解协议签署，但必须保证协议的合法、公正、平等、自愿，否则可能产生违约和诉讼的后果。