1、组培幼苗的幼嫩，组培幼苗在培养室的试管内培养，培养基是软性的，使得兰花幼苗和兰根很娇嫩，一不小心就能损伤兰花，所以在洗培养基、移栽时需要十分小心。第三是组培幼苗的抗病能力弱，组培兰花在无菌状态下生长，试管内一旦感染细菌，感染的兰花就会销毁，因此刚出试管的组培苗自身的抗病菌能力很弱，很容易受外界的细菌感染而死亡，随着硬化时间的延长，组培苗会慢慢适应有菌的环境，兰花自身产生抗体，所以硬化时间不长的组培苗开始阶段的杀菌工作很重要，但兰花又是根菌共生的植物，靠兰根上的有益菌分解植料中的养分生长，因此又不能过分杀菌。第四是组培苗对移栽后的环境温度比较敏感，兰花组培在培养室时的温度很适宜兰花的生长，如娇生惯养着的孩子，但一般的兰友移栽后的环境很难做到与培养室相近的环境，极端的低温与高温也容易使组培兰花死亡。
2、其实组培兰花幼苗并不难养，是相对自然培养的兰花而言难养些，只要在了解组培苗幼苗的特性后有针对性的养殖，就会显得与其他兰花差不多，等到硬化期较长后，正常管理下与一般的苗并无二样，尤其在组培苗硬化后逐步适应了自家的植料后，除了在光照和极端温度下注意外就不用专门照顾。
3、盆具要选择透气性好的小盆，通常是使用６－８厘米口径的中等高度盆，盆具小可弥补组培兰花幼苗根部呼吸较弱的缺点，使盆内的水分与盆面基本相一致，如没有透气的盆具也可用小的塑料盆，但在管理上适当减少浇水和加强通风。
4、上盆时可多株合栽，也可单独栽种，多株合栽对兰花的生长有好处，但遇到其中一株发病时会感染旁边的兰株，所以单株相对保险点，兰友可根据自己的条件和喜好选择。
5、植料使用到一定的时候也要翻盆，一般使用植金石的养殖时间是一年，植金石在养殖过程的施肥、杀菌时会积累无机盐和有害物质，更换植料时可采取清心、天使二位网主换化妆土的方法，也可如一般兰花的一样全换植料，前者的做法很少伤根与苗；四是及时清理腐败的龙根及根、枯叶，组培兰花幼苗的龙根和根有时会腐烂，龙根和根的腐烂会引发大量的有害菌，龙根和根直接连着兰花的芦头，会通过输送水和肥料的通道把带菌的腐烂质输入到兰花的芦头，使兰花感染死亡，这类情况的发生比较普遍，有效的办法是定期倒些盆面的植料，及时观察龙根的情况，一旦发现龙根有变质的现象，立刻分离龙根，并用杀菌药封闭分离的创口，要防止为观察龙根而经常性倒盆，分离腐烂的龙根和清理空根时要彻底，不要为了后期的龙根腐烂过早分离，健康的龙根是供给组培苗生长的营养仓库，分离龙根实属无奈之举，管理到位，龙根会存在一年以上甚至更长时间。
6、在兰花养殖时植料中经常会有蓟马等小虫，发生软腐的兰株内也发现有线虫，这些害虫会使兰根出现伤口和传播有害菌，使组培苗发病死亡，因此定期杀虫也很有必要，一般是兰花生长期每月一次，要选择低毒且有针对性的杀虫剂，严格按推荐的安全比率稀释，否则要么杀不死害虫，要么发生药害危害兰花，最好是使用如除虫菊等的无害杀虫剂。