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A、BbTt(♂)×BBtt(♀)的后代基因型有BBTt、BBtt、BbTt和Bbtt,分别为雌雄同株、雌株、雌雄同株和雌株,A错误;
B、BbTt(♂)×bbtt(♀)的后代基因型有BbTt、Bbtt、bbTt和bbtt,分别为雌雄同株、雌株、雄株和雌株,B错误;
C、bbTt(♂)×bbtt(♀)的后代基因型有bbTt和bbtt,分别为雄株和雌株,C正确;
D、bbTt(♂)×BBtt(♀)的后代基因型有BbTt和Bbtt,分别为雌雄同株和雌株,D错误.
故选:C.